• 北方及東北方的玄武岩層間夾有沙岩與頁岩的互層，層理清晰，是標準的漁翁島層的地形景觀。
• 北岸地面有一石英砂層，爲外來岩石崩碎而成，此石英砂層透水性佳，植物不易生長，外表相當貧瘠，故形成似惡地之地形。

小門嶼地層含有鐵質石英砂或沙，泥層及殼灰岩兩層的露頭，其中以西嶼社會福利館的西邊最爲明顯，故將此種地層稱爲小門嶼層。

原為一玄武岩海崖，經過海水侵蝕作用，不斷的侵蝕，終成現今的「海蝕拱門」，讓人認識了海蝕地形的演進過程。

• 鯨魚洞前有良好的露頭，可觀察玄武岩熔岩流掩覆在沈積岩上之狀況，其間尚可發現熔岩噴發後覆蓋的植物形成一層炭化物，局部地方尚保有生痕化石。
• 往東有兩根直立的海蝕柱。
• 對面有一排柱徑粗壯的風化柱狀玄武岩壁，其下方有一層約1尺厚的黑色物，它是由熔岩噴發覆蓋的植炭化後形成，在此砂頁層炭化物附近還可發現部分生痕化石。
• 鯨魚洞上端或附近的玄武岩節理剖面受雨水溶蝕與風化作用，在節理交接處常可發現漂亮的風化紋，仔細探查必有所獲。

爲了阻擋強烈的東北季風，澎湖人利用硓砧石或玄武岩在田埂附近砌堆成防風的石牆，稱爲「菜宅」，在小門嶼島中央的低窪地可見到整片玄武岩築成的菜宅，此人文景觀十分引人入勝。

1. 機車／汽車：由馬公市區沿縣道203至東衛左轉，途經白沙鄉，過跨海大橋，於縣道203約26公里處右轉續接鄉道澎2，即可抵達。
2. 公車資訊：搭乘外垵線經小門的班次，即可抵達小門嶼。時刻表-藍線-外垵線
3. 臺灣好行：時刻表-媽宮北環線

1. 攀爬至鯨魚洞請務必小心。
2.冬天東北季風影響海浪大，建議勿過於靠近海岸，以免發生危險。